Jätkäsaaren peruskoulu edustaa uudenlaista kouluarkkitehtuuria, jossa perinteinen luokka-käytäväjako on korvattu avarilla monikäyttötiloilla. Se on ensimmäisiä uuden opetussuunnitelman mukaisia koulurakennuksia Helsingissä.
Rakennuksen keskiössä on korkea ja näyttävä atrium, jonka kattoikkunoista tulvii runsaasti luonnonvaloa. Tila toimii sekä oppilaiden oleskelupaikkana, ruokailutilana että juhlasalina. Valaistus on toteutettu Intran Pipes-riippuvalaisimilla, jotka sopivat hyvin avaraan ja valoisaan tilaan.